高慧君清楚记得去年10月8日，她早上一觉起来，左右眼瞳孔变成一高一低，她先去家医科就医，再转诊到台大脑科，确定不是脑中风引发，再往眼科，医生诊断出典型甲状腺引起眼疾后，再转风湿免疫科，最后再回眼科门诊。总之，前半年她「层层关关跑医院」，也接受筋膜老师调理甲状腺数值3个月，双管齐下治疗。
突然病发让她陷入低潮，「我觉得对不起我妈，为什么我的身体会搞成这样」？之后她告诉公司病情，放掉所有工作，「那个过程是最痛苦的，我每天哭，想著我未来该怎么办」？如果不能再做最喜欢的演员，她到底还能做什么，「我连Uber Eats都不能送，又不会骑车」，进演艺圈前她卖过灵骨塔，但现在也不用推销，脑中不断思考出路，边哭边想了两周，决定放下这些念头。
今年4月她原本就要开刀，但因甲状腺眼凸的问题，先得解决眼凸后，休息3个月再处理斜视，之后她甲状腺数值恢复正常，确定10月开刀治疗，但她听过有人得开两次才好，是否担心过开了也无法恢复过往，她说「如果开了不好，只是离开了最喜欢的工作，大不了回山上种菜养鸡，我搞不好是一个很厉害的小农啊」。
只是从病发到手术等了1年，前一刻她竟打退堂鼓，其实她自认沉稳耐痛，应该可以克服局部麻醉的心理障碍，但一想到手术刀在她眼皮上就莫名害怕，不过她看到年长的阿姨伯伯都撑著拐杖来，心想长辈都可以克服了，「我也可以」，加上她祷告后增添信心，最后顺利进行。
护理师事前叮咛，若感觉到麻药快退，就赶紧告知医生，会再补打麻药，但手术收尾时，她已感觉到痛，「我想上眼皮7针，下面应该也6、7针，忍一下就过了」，但万万没想到会如此疼痛，手术针勾著她的肉，要拉要绑要割，她在麻药退去时忍痛约10分钟，时间过得格外漫长，「我不敢乱动，头以下的身体都在颤抖，等我起来时，手术床都汗湿了」。
手术后，护理师看她流了满身汗，问她热怎么不讲，她回「不是热，是痛」，立刻被念「没有人忍这个痛」。也有民众看到她换下湿掉的手术服，告诫她不能忍，万一有心脏问题该怎么办？能忍这种痛也非常人，高慧君说演员有种厉害技能，像是在热天穿毛衣、寒流穿短袖拍戏，「那是意志力的控制，开刀时我突然想到已忘记的《天主经》，开始一个字一个字找回记忆，去分散疼痛」。
开完后，她明显感觉眼睛里的异物感，前3天她仿佛戴上VR眼镜，「每一个东西都变3D，就像坐船很久，在船上不会晕，到陆地上会晕」。总之习惯了单眼的距离感，恢复双眼后一切得调适。此外，她更必须注意甲状腺的数值，得补充甲状腺素，每月验血，尽量不搬重物、不碰水，基本上3个月是最完美的术后期。
她预计年底可以复工，目前先稳定休养，同时恢复52公斤的标准体重，还有10公斤要努力。生病的这1年，有酸民以她的经典歌曲《你最珍贵》酸她身材「婶味足够」、「你最珍重」，甚至看到她戴眼罩现身，批评「你觉得眼疾很好玩吗」。但也有很多人为她加油打气，「这些都是正能量，会集中让这件事（康复）往很真实的方向，我就会好，就会慢慢康复」。
