2018年卡管案闹得沸沸扬扬，让台大长达百日群龙无首，最终教育部宣布「勉予同意」管中闵出任台大校长，也才终结台大无校长局面。
由于管中闵即将卸任，在最后一次的校务会议中，他也坦言即将卸任的心情是如释重负，随后便谈到了当年教育部的勉予同意，管中闵说，4年走来与学校共同发展，所有的成功都应该归功于行政团队，他们也是4年来台大的支柱，对于这些成果，希望师生们不是「勉予接受」而是乐于肯定。
话锋一转，管中闵指出，这4年的校务经验，让他知道「离真正的大学自治尚远」，没有真正的大学自治，台大和其他大学就难以脱胎换骨、充分发展。接下来卸任后，也会持续关注这项议题，同时回到财金系后会持续教学研究工作。
另管中闵接受联访时被问及4年任期中，将台大的收支余绌由负数转为正数，对于如何做到，他指出，第一个经费使用方式，再来是财务投资，以及校友的捐款，这也可以减轻负担。
出身管理学院财金系的管中闵也幽默表示，「我这个系还是有用的」，台大收支能由负转正，而且是从负6、7亿到转正，这不是只把经费东发西发，而是做很小心的规划，但这些东西前几年没有特别讲，因为财务东西不是只看一年，都是一段时间的，他等了4年才能讲，「苦啊！校长苦不能说」。
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