谢长廷表示，很遗憾在他快要卸任时，有一艘台湾渔船遭到日本方面逮捕。过去8年来，虽然有渔船被驱离的情况，但遭逮捕是8年来第一次。对此，他深感遗憾。
不过，谢长廷坦言，「我的任期也快到了，要讲一点得罪人的话。」那就是「不该纵容少数违规渔船，破坏台湾与大多数渔业界的利益，因为台湾的渔船大多数都是守法的。」
他表示，日本通常会先对违规渔船发出警告，台湾的渔业署也有监控单位。然而，这次的状况是屡劝不听，据知还有挑衅行为，日本方面才动手，「这是非常例外的情况。」
谢长廷表示，听到船东谴责日本「比中国更土匪」，他感到非常遗憾。「因为就算照台湾自己划的界线，该渔船也是越界。」海巡署不能去支援，因为是在界线以外，台日之间有渔业协议很不容易，虽然有些有争议的地方，但这个地方是没有争议的，该渔船就是越界。
谢长廷说，而且船东须清楚，该渔船船长的情况是被逮补，缴交的是担保金。如果船长没办法在当天立刻交保，就必须被戴上手铐，希望社会能了解这个过程。「他（该渔船船长）违法，我们警告，叫他回来（回航）他不回来，最后被逮捕，交担保金把他保释回来。当然，他如果不出庭，日方会没收他的担保金；如果出庭，还是可以拿回的。」
谢长廷指出，台湾和日本相互尊重，每年有10多人接受急难救助，日方都有协助，无论是跌落公海、疾病，甚至打架，日本都有来支援。「这是全体的利益，但少数违规是个人的利益，在我看来不应纵容。这是牺牲台湾整体利益，牺牲渔业界的利益。」
「福洋266号」事件透过交涉，日方同意只要船东缴交担保金600万6000元日圆（约新台币121万3000元）后，人船就可离去。当天傍晚蔡姓船东完成汇款手续，在签署切结书后，日方将船长送回「福洋266号」渔船。（中央社）
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