邱毅指出，2019年3月21日，时任总统蔡英文的办公室流出一份密件，针对的对象是赖清德，当中提到「有人挡路，务必清除，不计代价，不择手段」，但当时蔡英文方面否认，并称是骇客入侵伪造、变造的黑函。
不过他说，现在回想起来，这封被称为黑函的密件，倒有相当的玄机，当时蔡英文是现任总统，整合各系统，密谋对付赖清德，密谋小组包括时任民进党主席卓荣泰，行政院长苏贞昌，新潮流大姐大陈菊，立法院党团总召柯建铭，确实是一张天罗地网，十面埋伏擒蛟龙的态势；最重要的是，密谋小组押阵的就是蔡英文最倚重的心腹郑文灿。
邱毅表示，郑文灿当时的身分是桃园市长，为什么参加密谋小组，显然是代表蔡英文出席，甚至还有监军的味道，如今看来赖清德深恨郑文灿，欲除之而后快，是有脉络可寻，这也说明赖清德不计代价、不择手段，务必要清除郑文灿，就是针对四年前「蔡赖内斗」大复仇。
他认为，「看来赖清德不会只对付郑文灿，郑文灿背后的人，也是他要复仇的对象！」
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