《孙行者传》首先完整呈现2个角色在原著中变身成的各种动物，由于孙悟空和牛魔王同样神通广大、法力无边，更都拥有72变的能力，正是对方的敌手，首战就化身为各种鸟类进行一场激烈空战，各自陆续变为天鹅、海东青、黄鹰、乌凤、白鹤、丹凤，除了动画师努力表现这些飞禽在空中追逐缠斗的模样，导演庄家修更感谢由杜笃之老师领军的金奖配音团队声色盒子，「配音师花了很多时间从他们的声音资料库搜寻这些鸟类的叫声，一一修改制作音效后再混音，制造出紧张争斗的气氛」。
片中最令人印象深刻的莫过于片尾众神齐聚场面，众多佛兵天将从四面八方包围牛魔王，在3D画面上气势十足，而电影团队为绘制出众多神佛做足功课，导演表示：「我们参考大量的影像、图片及文献，以确定他们的外型特征及武器。」
他以「4大天王」为例，4位神佛身穿的衣服颜色分别为白、青、红、绿，手上神器更各有特色，「不论任何神佛基本的外型特征及武器，我们绝不能做错，而且一定要威武庄严慈祥」。
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