投诉者指出三点，一是今年3/17以公司营运困难为由，资遣10%人才后（资遣可以选自愿与非自愿，大部分选择自愿，但调阅3/17离职人数为异常），并于6月宣布细胞治疗工厂动土，之后在104开始征才。
第二点是资遣后，永昕调派台北分部多余人才前往竹北总部进行训练弥补缺额，代表台北分部人员过多足以进行支援。
第三是104人力银行刊登竹南GMP厂征才，但在3/17资遣名单中，资遣了大部分竹南GMP二厂品管人员，如今却又重新进行招募。
3月时《壹苹新闻网》就已接获永昕裁员的独家爆料，非自愿与自愿离职人数超过40人，员工质疑资遣名单大部分是KPI良好的员工，不知裁员标准为何？且资遣后又马上调薪。
当时永昕说明，调整人力没有超过40人，因考量市场与公司整体营运需求，过去传统微生物订单下滑，未来朝细胞治疗转型，因此重新调整组织人力。调薪则为年度计划，希望能让留下来的员工安心。
据了解，此次招聘与先前裁员所需的员工为不同部门。根据永昕在104的征才资讯，共提供12个工作机会，扣除工读生与总务、会计行政职缺后，专业职能缺剩7个，包含苗栗厂副工程师、品管分析资深工程师、化学层析工程师与新竹生医园区生物药分析研究员等。
永昕今年上半年营收3.56亿元，年减5.49%，今年首季税后净损2.4亿元。
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