(新增：指挥中心回应)
国内4到6月Omicron本土疫情主要流行病毒株为BA.2.3.7，中央流行疫情指挥中心医疗应变组副组长罗一钧先前报告指出，基隆小吃店、大潭电厂、台中婚宴群聚等序列皆属BA.2.3.7，儿童重症定序结果也大多是BA.2.3.7。
三总今年4到6月本土疫情期间收治了6位儿童确诊并发脑炎重症，年龄介于1到17岁，都没有接种新冠疫苗，经病毒全基因定序，发现皆为BA.2.3.7病毒株且带有K97E突变位点，三军总医院临床病理科主任商弘升表示，这是国际上首次为儿童新冠确诊并发急性脑炎找到致病的突变位点。
商弘升进一步说，依据相关研究，K97E这突变位点可能让病毒更容易干扰被感染者的免疫系统，进而诱发免疫风暴，演变成急性脑炎或全身系统性的发炎疾病。日本及香港在相同疫情阶段，虽然也有小儿染疫后并发急性脑炎、热痉挛的临床报导，但直到三总此次研究结果才找到解答。
三总小儿科部主任、小儿神经学科专家陈锡洲则说，从三总收治的重症病童中可见到多样发炎指数异常升高，代表病童全身性免疫系统被高度激发与活化，虽然这些病童中枢神经系统中暂无病毒感染的证据。
三总此次研究成果已刊登于国际感染症领域知名期刊「International Journal of Infectious Diseases」，未来拟与国卫院及国防医学院预医所进行此突变位点(K97E)更多致病相关机转的试验分析。
国内12岁以下儿童重症，今年已累计31例脑炎，其中2例发生于BA.5本土疫情升温后，陈锡洲指出，相较于上一波BA.2.3.7疫情产生的儿童脑炎个案，原本多为身体健康，最新2例发生在BA.5疫情升温后的儿童脑炎，个案本身就有疾病史，推测波儿童脑炎的致病因子不同。
商弘升也表示，最新2例儿童脑炎个案并未找到K97E突变位点，未来会持续针对BA.5疫情间的儿童重症个案进一步做全基因定序，是否有其他位点会引起脑炎，有待后续研究。
在指挥中心今下午记者会上，罗一钧也说明，目前12岁以下儿童重症共206例，其中脑炎占31例、15%，其中死亡共12例，不过本波脑炎个案是否会像上一波一样增加那么多，目前还在观察中，而三总今公布新研究，则是说明上一波BA.2疫情中的6个小朋友个案病毒序列。
罗一钧也说，该研究中个案都是感染BA.2.3.7，即是BA.2的细分支之一，且带有K97E的突变，研究上看起来，脑脊髓液没有病毒核酸反应，但有免疫风暴的细胞激素上升情况，推测可能是借由诱发过度免疫机制引起脑炎，但香港的脑炎个案当时并不具有K97E的突变，因此研究还有待更进一步的试验，以证实该突变对于免疫系统调节与神经系统入侵的关联。
