潘文忠在2016年入阁后，却因为当年台大「卡管案」请辞，不过在事件结束后，潘也再次回任教育部长，两届任期累计已经达5年9个月之久，也是史上任期最久的教育部长。
随著绿营九合一大选惨败，总统蔡英文辞去党主席、行政院长苏贞昌口头请辞但被慰留，外界也认为接下来将会内阁改组，潘文忠就在名单内。
针对改阁一事，潘文忠则简单回应，谢谢大家关心，教育事务很多都在持续推动，只要自己在工作岗位的每一天，都会跟部内同仁持续去推动教育事务。
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