九合一大选落幕，民进党惨败，仅拿下2都3县，为此总统蔡英文辞去党主席，行政院长苏贞昌虽口头请辞却被慰留，有媒体报导政院可能进行小幅改组，包括行政院副院长沈荣津、财政部长苏建荣都可能下台。
而薛瑞元在选前抛出「疫苗掮客说」，也被外界认为干扰到陈时中选情，选后大家开始找猪队友、抓战犯，薛日前说「绝对不回避政治责任，但政务官对自己政策辩护，以及支持自己党籍候选人，是天经地义」。
薛瑞元今上午出席健保署「健保医疗资讯云端查询系统标竿学习分享会」，再度被问及内阁改组，是否辞职，他先苦笑说：「你们不要问我这个啦！」随后强调「我个人的去留不重要」。
另薛瑞元表示，内阁改组是全盘考量，一次的选举失利不该因此让施政延滞，当然党内目前检讨中，是否有一些内阁改组或幅度到怎样，不是阁员去做决定，要看最后组阁的团队如何决定。
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