桃园机场第三航厦2025年启用，桃机过往曾规划依照3个国际航空联盟做分配，让相同联盟航空公司分配在同航厦，华航所属的「天合联盟」与其他航空进驻第三航厦；长荣与其所属「星空联盟」则分配在第二航厦；「寰宇一家」航空公司及廉航则分配在第一航厦。
不过后来又传出改以航线分配，引发华航企业工会不满到桃机递上陈情书，发言人黄慧甄表示，如此方式将使航空公司不同航线班机分配在不同航厦，造成国人及旅客转机不便，更增加走错航厦错过班机的机率以及时间成本。
对此，王国材今出席交通部道路安全记者会受访时表示，桃园机场第三航厦2025主体启用，2026年全面完工，一开始用联盟方式分配，但各航空公司有不同看法，目前改以运转考量来分配，包括是否集中哪个航空公司全部进驻第三航厦，或是部份在第三航厦、部份在第二航厦。
王国材说明，目前国际航空有三大联盟，但现在发觉分配起来也不是很平均，因此初步比较定案的是第一航厦由低成本航空进驻，第二、第三航厦分配上，长荣、华航、星宇都想进驻第三航厦，由于都是国籍航空，必须公平对待。
另王国材指出，他已请民航局跟各航空公司讨论，初步看起来第三航厦租金会比第一航厦高，先请民航局把租金摊出来让航空公司看一下是否做此选择，第三航厦租金会比较贵，但至于多少，民航局还在算，或许谈过之后，各家航空公司想法会不一样。
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