台北医学大学附设医院晚间发出声明表示，有关此事，虽仍于了解阶段；为以示负责，邱仲峰院长已于今天请辞，院长一职由张君照副院长代理。
《壹苹》还原整起不伦事件，3/20下午4时许致电邱仲峰院长本人，针对3/14和杨智惠共度午餐送礼、3/16相约共赴礁溪长荣凤凰酒店泡汤，邱回应：「吃饭当然业务往来会吃饭，但没有啊？哪有去什么温泉旅馆？」、「奇怪了，怎么会有这种消息？奇怪了⋯⋯」
邱仲峰还强调，3/16当天他根本没有这类行程，但也对记者致电确认表示感谢，但也略带不满表示，相关讯息还是要查证一下，求证、查证后才不会误传消息，平白伤害公信力。
问到和杨智惠的业务往来，邱仲峰说，北医附医与杨智惠所属公司的细胞治疗、临床试验有业务往来，也有正式签署产学合作合约，医师也常被邀请去当顾问、提供科学指导，且最常与公司互动的是院内几个细胞治疗专家，双方会固定聚餐，他只是很少才会出席一次。
过1小时后，《壹苹》接获杨智惠回复也同样口径否认，表示「没有一起去泡温泉这件事」，她人在台北，怎么可能去泡温泉？被问到确实有拍到和邱院长一起到礁溪长荣，她回说：「应该不会吧！」「你们会不会搞错」。另外，她也说明3/14是她生日，当天她有很多餐会，有不少人送她礼物，也认收了邱院长送的施华洛世奇礼物，她说：「当天是我生日，就是大家给我的祝福吧！」
昨晚6时后，北医院方透过公关来电，想知道更多细节但无所获。随即传出公关数度进出院长室，商讨危机处理事宜。
北医公关在同日晚间提供院方回应内容：「杨教授长期任职于知名生技公司，在细胞治疗业务上与本院有多项合作，目前正在进行二项产学合作计划，亦曾多次到本院分享创新创业经验，平时与细胞治疗中心、创新前瞻中心等团队多有餐叙、互动频繁，盼外界勿过度联想。」
今天上午「壹苹10点档强打」报导邱仲峰不伦事件，系统一度出状况出版10分钟，北医截图在院内四处流传，事件扩大，惊动北医董事会，董事李祖德冲到院长室，院外揣测邱应被当场要求自行请辞。直到今晚5时许，邱仲峰发出内部信，表示「绯闻事件媒体报导造成很大困扰」，恐怕多做解释不会有帮助，以身体需要保养为由，请辞院长职务。
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