邱仲峰解释，目前世界已经有108部质子治疗设备运作中，全世界接受质子治疗的患者数也突破式的上涨，台湾则有12间医疗院所申请建置质子治疗设备并得到核可，美国放射肿瘤协会则公布双侧乳癌、有心肺疾病、第二次放射治疗等适应症，符合者可申请保险，且适应症内容还在逐步增加当中。
针对北医附医现况，邱仲峰说，针对年轻、40岁左右，病变发生于左侧，有心肺疾病的患者，会主动告知有质子治疗此一选项，每个病患都会跑过质子治疗与光子治疗后的预测图，可以明显比对出差异性，让病患有其选择依据，心脏剂量可降低85%、对侧乳房剂量降低85%、肺部剂量降低50%。
至于未来质子治疗是否有机会纳入健保，邱仲峰说，对此卫福部监督委员会已提出相关提议，但卫福部表示，未来会支应，但要等更普及化，否则只有少数几间医院受益，而卫福部有委托放射肿瘤学会制作5年白皮书，他推测五年白皮书走完可能就是时候了，近期希望先将质子治疗的健保给付提供给儿童，推估一年需付出新台币2.5亿元，也认为政府应该出得起这个钱。
对此健保署长石崇良表示，目前尚未接到来自学会的建议案，而各项治疗方式纳入健保有其一定的程序，首先需要经过医疗科技评估（HTA），确认其适应症、应用人数等资讯，尤其质子治疗适用的癌种众多，另需确认治疗方式是否比传统是否带来更多效益，并进行财务冲击评估，后送入专家会议讨论、召开共拟会议进行决策。
不过，石崇良也提到，虽然目前有12间医疗院所提出质子设备申请并得到核准，但实际有在运作、或即将上线的仅有高雄长庚、林口长庚、北医附医、台大医院等，其他医疗院所则可能在规划或建制阶段，因此还要考虑治疗普及性问题，不能说只有一两家能做，导致所有病人都要挤到特定医院，产生医疗不平等的情况。
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