此次三读通过的农业部共设8个三级行政机关、7个三级试验研究机构，8机关包含农粮署、渔业署、动植物防疫检疫署、林业及自然保育署、农村发展及水土保持署、农田水利署、农业金融署、农业科技园区管理中心。
7机构为农业试验所、林业试验所、水产试验所、畜产试验所、兽医研究所、农业药物试验所与生物多样性研究所；本部设有8司6处，包含综合规划司、农民辅导司、畜牧司、农业科技司、国际事务司、资讯司，另新成立资源永续利用司和动物保护司。
农委会主委陈吉仲担任部长呼声高，对此，陈吉仲回应，这问题非常难回答，农业部三读通过不是只有我自己充满感动，所有农委会同仁、从业人员等长期期待，我们的工作就是回应农渔民诉求，未来农业部长是总统、行政院长职权。
升级农业部后，将致力气候变迁的农业调适、净零排放政策、增进农村规画及发展、粮食安全储备机制、推动全民食农教育、强化动物福利等、落实宠物管理等，但2大终极目标就是让农民所得增加、消费者购买到安全农产品。
人事室主任陈慧嫔表示，目前农委会预算员额4770人，行政院目前核给农业部5300人，主要以林务局员1000余人，升级成林业及自然保育署后会再增加100多人；另外，农村发展及水土保持署、资源永续利用司、动物保护司都会去争取人力。
会计室主任苏文树说明，今年公务预算1506亿元，基金预算736亿元，加总约2236亿元，目前行政院核定2024年「农委会」公务预算比今年增83亿元、达1589亿元，由于农业部才刚通过，未来还会再争取，至于2024年的基金预算尚未筹编。
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