邱显智说，国安会、移民署面对涉密人员违反《国家机密保护法》，提前出关让管制国门的法规形同虚设，应该立即启动内部行政调查，该惩处的就惩处；其次，为厘清真相，请移民署公布当日处长与基层同仁发生争执之影像画面，以昭公信。
针对立委揭露此案，总统府上午也紧急道歉，表示这名高层为国安会会内辖理行政工作的事务官，属应受出境管制人员，经申请核准于1月22日出境，但因航班起飞时间为22日凌晨12时15分，这名官员才提前于21日晚间10时许进行出关查验，但因核准出境时间未到而未被放行，并因此与工作人员争执。
总统府发言人林聿禅表示，尽管该员此行出、入境均依其申请起迄时间办理，但因沟通不当、致生误会，国安会除依规定处理、检讨外，并向相关单位及负责人员表达歉意。
移民署说明，当事人事前已依相关规定向服务单位完成出国申请程序，因班机表订时间为翌日0时15分起飞，当事人请假时未考量须预留机场通关及登机作业时间，故查验出境时遭拦查。经移民署国境事务大队确认「当事人已完成出国申请程序」并协助通关，该班机于0时8分起飞。
移民署提醒，涉及境管人员欲出国前，除向服务机关提早完成出国申请核准程序；如出国班机为凌晨起飞者，务必将核准出国日期提早一天，以利通关作业顺遂。
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