北院审理时，黄惠玟、陈奂宇、陈昱恺3人认罪，并请法官依法减刑且宣告缓刑，王郁文、高虹安则始终否认犯罪。
高虹安辩称，她一再确认合法性才同意采用零用金制度，且助理都有实际加班，时数也都超过上限，有资格依法申报请领加班费，助理也在申请单签名盖章，她才核批。此外，办公室的零用金非她保管、支配，她也没有挪为私用，助理酬金及助理费入助理的帐户后，就是助理的私人财产，是否捐出来当零用金，均由黄惠玟询问助理意愿。
高虹安还说，与助理对零用金的认知都是用在公务上，助理认为有公务需要，就可以支用，不必知会她，她也没有浮报、虚报助理酬金或助理费，不可能诈领助理费。北检公诉检察官则论告指出，高虹安诈领犯行是低薪高报、制作助理酬金、加班费差额，以施用诈术方式领取公款。
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去年8月14日，台北地检署认定新竹市长高虹安于立委任内诈领助理费新台币46万30元，经度传唤高虹安说明，历经8个月侦查终结后依《贪污治罪条例》公务员利用职务机会诈取财物罪、公务员登载不实罪起诉高虹安及办公室主任陈奂宇、黄惠玟、助理王郁文、陈昱恺等5人。北检痛斥。高虹安财力丰厚却贪图小利，压榨助理诈领助理费46万30元，犯后态度不佳，依贪污等罪起诉，建请法院妥予量刑，并宣告褫夺公权。
检方起诉指出，立法院于2020年度分别编列「公费助理」工作计划预算、「问政相关业务」工作计划预算。每名立委公费助理至14人每月酬金42万4360元，加班费每月8万4872元，每名委员有每月7万9072元的「问政相关业务经费」。此外，高虹安领有立委薪资19万余元，财团法人永龄教育慈善基金会另每月支应10万元给网路媒体公司协助高虹安从事立委职务。
检方还说，高虹安自2020年2月27日起至同年11月止，要求公费助理黄惠玟等人配合，以虚报或浮报助理每月受领酬金、加班值班费到预算上限金额，并将虚报或浮报酬金差额、加班费差额缴回给高虹安，供高虹安自行决定用途及运用。
北检统计，高虹安浮报助理酬金及加班费共计62万5238元，扣除实际用于支付公费或私聘助理薪资、奖金共16万5208元，总计诈得46万30元。另高虹安将这些款项用在餐饮、礼品、花篮、红包、高铁、计程车等个人支付的零用金支出，甚至连双眼皮贴、卫生棉、洗头、卸妆棉补充包、头痛药、台大医药费等都是个人使用。
起诉还痛批，高虹安拥有傲人的学经历，曾担任鸿海公司中阶主管，每月领有立委月薪19万余元及问政费用7万余元、银行存款达1200万余元，竟分毫不用问政业务经费，反压榨惮于权势的下属助理配合共同虚报、浮报酬金、加班费，流用于委员办公室及个人私用等支出。
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此外，资策会指控高虹安于资策会任职期间，因职务研发成果取得专利，专利申请人却不是资策会，因而控告高虹安涉犯背信罪，但北检认定没有积极证据证明高虹安犯行，对她不起诉处分。
根据地方制度规定，县市首长若涉嫌《贪污治罪条例》等罪，经一审判处有期徒刑以上之刑者，将停止其职务，若经二审改判无罪，可复职；但判刑确定者，将解职，并于3个月内完成补选，但若剩余任期不足2年，就不再补选，由内政部报请行政院派员代理至任期届满。高虹安明天一审若因贪污罪被判有罪，将依规定停职。
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