民进党立委邱志伟在脸书发文还原学生时代写论文的过程。邱志伟说，1998年因为美中台三角关系正热，台湾也兴起了中国研究热潮，而台湾大学三民主义研究所，也就是现今的国发所，当时是中国研究的重镇之一，因此他报考台大三研所大陆组一般生，他也有幸能通过考试，进入中国研究的大门。
邱志伟赞陈明通在地方派系研究上相当杰出，但同时，也深耕当年还属新崛起领域的中国研究。加上对陈上课内容感到相当契合，因此自然的选择陈明通作为指导教授。陈相当关心学生，在他撰写论文期间，每周都必须和老师meeting，论文草稿陈都非常细心提供各种修改建议。但一次次的修正论文，确实也让问题意识更明确、内容更加严谨，分析架构更加清晰。
邱志伟回忆，2000年毕业时，三研所正式改名为国家发展研究所，他也因此成了更名后国发所的第一位毕业生。在就读研究所的这段时间，他仍相当感谢陈明通的指导与协助，让他能在中国研究打下不错的基础，并且顺利完成7章17节，共计185页、9万余字的硕士论文。而他毕业后顺利考取中山大学大陆研究所，继续攻读博士学位。
邱志伟坦言，2000年台湾大学的离校手续，仅有规范要缴交硕士论文纸本，并没有电子论文的要求。经查现在的台湾博硕士论文知识加值系统，是自2010年才上线，但在他念台大研究所的年代，并没有这样的电子论文系统。毕业时，均按照台湾大学离校手续规定，缴交纸本毕业论文，在国家图书馆皆可查询，绝无所谓173位论文不公开的说法。
邱志伟最后强调，当年认识陈明通时，陈并无任何官职，仅是单纯的台大教授，他是老师的第12位指导毕业学生。至今，他依然相当感谢陈明通教授的指导，尤其是对论文撰写过程给予相当多建议，令他获益良多，「我从不忘师恩」，也希望外界许多不实的影射、错误的传言，皆能够尽早结束。
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