柯文哲9月起陆续针对医疗、长照、教育、财政、壮世代、净零碳排、少子化、产业、族群文化、劳动、农业、运输、金融等面向提出政策主张，政见发表会前夕，他列举当前政府制度面临的6大问题，抛出6政见促完善国家治理。
6大问题包括：一、总统有权无责，政党零和恶性竞争；二、国会选制图利蓝绿两党；三、文官体制沦为蓝绿酬庸标的；四、财政制度破洞百出；五、司法失能，犯罪泛滥；六、政府数位治理落后。
针对总统权责、立法院选制，柯文哲直言，台湾总统犹如民选皇帝，赢者全拿，却不用负责，他主张总统定期到立院国情报告、接受立院各党团质询；立委选举由「并立制」改为「联立制」，建议分配门槛从5%降至3%，不然小党永远没机会出头。此外，推动选举年龄下修，达到「18岁公民权、20岁被选举权」，并纳入审议式民主、循证式原则的「公民会议」和「参与式预算」，让台湾民主更进步。
文官体制方面，柯文哲主张，高阶文官跟国营事业董监事应公开遴选，并设政治任命的上限，解决肥猫问题，他批民进党创造许多黑位，形成政治统治集团，吃香喝辣，选举拼命是因为选上一口票人有工作，柯强调自己当选，会列出所有相关名单，让大众检视。
柯文哲指出，政府应该采企业式经营精神，公务员人数不用那么多，但薪水要提高，避免行情跟业界差太多，聘不到合适、优秀的人才。
柯文哲续指另一国政问题、财政破洞，地方政府财源超过八成都靠中央补助，颜色对拿得到钱，颜色不对拿不到，地方难自治，必须重建「补助款与统筹款」机制，让地方财政自主。此外，台湾税率很高，但总税收少，意味漏税严重，必须翻新税制，改善课税不公问题。
柯文哲也提到，特别预算法一定要修，前瞻计划8400亿根本是绑桩，他抛问民进党政府能否列出前瞻用途供检视，他批政府大撒币纯粹是为了绑桩，而非为国家长期发展考量，因此，要修正《特别预算法》，落实财政纪律。
最后在司法、数位治理上，柯文哲主张设置「司法改革委员会」，提升司法系统的透明与公正度，设置「国家司法科学委员会」，改善司法科学、鉴定制度，同时有必要推动并《吹哨者保护法》，以及《刑法》中「不法餽赠罪」、「影响力交易罪」等罪，以有效打击犯罪。
柯文哲也主张推行电子身分证，将「个资保护委员会」升级二级独立机关；设立「国家数位转型会议」，完善数位相关法制，加重处罚泄漏个资公私部门；同时辅导产业转型，鼓励培育数位人才。
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