国安会现任三名副秘书长分别为陈文政、徐斯俭及刘得金，其中陈文政即将退休，现任总统府副秘书长黄重谚曾一度传出出任副秘书长或咨询委员。
不过据《锋灿》新闻指出，林飞帆将进入国安会任职，职位将是副秘书长或咨询委员，而他本人则说「此为总统人事任命权，以新任总统团队公布为主，我没什么其他回应。」
绿委许智杰则大赞，林飞帆从外交、协调、新时代3面向来看相当适合；国安议题需要跨国合作，林飞帆伦敦政经学院毕业，担任副秘期间国际交流经验丰富 ；且林飞帆过往是太阳花领袖，担任副秘书长期间许多部门沟通顺畅，是调和鼎鼐的角色。
许智杰说，面对瞬息万变、资讯快速流通的认知战，更需要纳入新生代，加入不同世代的观点，同时也能培育国家的人才。
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