就涉及京华城涉图利、贪污受贿部分，柯文哲在法庭上重申检察官臆测想像、拼凑编故事、抹黑，如同网军、名嘴、写小说、侧翼，对他有利的却不闻不问，「很可恶」，另外，只要提到李文宗他更生气，还是那句话，仅凭一通简讯就押他11个月，还污蔑他，根本就是「文字狱」。
自认在京华城案一直被闷棍大的柯文哲，利用答辩机会彻底地「检讨」检方作为，他先描述去年8月30日检调兵分55路大搜索，到他家及办公室翻箱倒柜拿走手机、电脑等，是国内「史无前例」的创举，审理期间，检察官抱怨他，只要有风吹草动就有小草声援(包围北检)，但检察官办案也有行政优势，就如同唐朝《罗织经》所说的罗织入罪，就是政治侦防，用臆测、想像，拼凑故事办案。
对于京华城案，柯文哲说，2023年3月监委主动调查，2024年1月24日纠正北市府京华城案的审议过程有重大过失，民进党却在同年1月8日就先开记者会说明，北市府后来说明审议过程均符合法令程序，检方却臆测想像、拼凑故事，最后变成抹黑。他引西方正义女神蒙眼，告诉检察官，做任何事不要先预设立场。当时心想，他连容积率多少都不知道，检方扣他手机、电脑后就开始编故事，指他参加三次便当会，还在公文签字要求加速京华城容奖研议、审议流程，却指控他此举是要图利京华城，「欲加之罪、何患无辞」。
柯文哲还提到离谱的是，他根本没有应晓薇的联络方式，也没跟她吃过饭，何来共谋图利京华城。另对送研议，柯说看过公文，因为都发局送都委会讨论，市长原则上不会不同意，毕竟这是专业，难道要他直接下决定，这样才会有图利的问题，检认为盖章就说是图利，很可恶。
至于检察官指控相关公务员抱怨京华城案送研议不合法，柯文哲更不爽地说，副秘书长李得全说过没有问题，才将公文送出，当时的秘书长陈志铭也说，若案件不合理就会在晨会讨论，京华城案没有任何公务员接受过他的指示，检察官如网军、名嘴、写小说，选择性提出证据，很多证据都已被污染，又有预设立场，甚至有部分被告因为怕被关，最后认罪。
提到李文宗，柯文哲一度大声动怒说，最生气的就是检察官仅因李文宗的一通简讯就押他11个月，还要污蔑他，他完全没参与京华城案，这就是文字狱，至于检方提出的「小沈1500」、「EXCEL PAY」也都兜不起来，都是检察官在写小说、编故事。另外，柯在答辩过程中，想到同学、家人照顾不辞辛劳照顾父亲，不禁流下眼泪说，这是他最过不去的槛。
辩论程序后阶段进入政治献金部分的公益侵占、背信等答辩时，柯文哲也花了40分钟答辩，他表明自己为人节俭、家中没有佣人，回忆起妻子陈佩琪曾跪地擦地板一幕，突然忍不住哭出声。
柯文哲很感谢法官3个月前裁定他交保，让他能回家阅卷，提早为诉讼进行准备。全案共有2814页卷证，至今也只看了四分之一。其实，京华城案看似复杂，但核心就是「柯文哲到底有没有介入京华城并指示图利」，其实，全案关键就是因政治介入而变得复杂。起初，他看媒体自去年4月起接连报导，还心想「再怎样闹也不会闹到我身上」，因为根本不知道京华城有多少容积率。
对于检方论告时一直提到「公平」，柯文哲怒斥，若检方一开始就「公平」看待此案，就不会落入今天的局面，「检察官扭曲事实、窜改北市前都发局长黄景茂笔录，一再用抹黑手段称『市长室秘书施压都发局」』，最后也没查出那位秘书是谁。」该查的不查，很可恶。
谈到政治献金，柯文哲说，起诉他并求刑13年，就连「KP SHOW」、投资邱复生都被列起诉，政治献金就是捐给他和民众党的，查了1年多，包括家人、党部都查了，就连陈佩琪过世的父母帐户也都被查，最后查到什么？「没想到柯文哲那么干净！总统赖清德、新北市长侯友宜卸任后，是不是也要查一下？」最后搞到民众党幕僚「人人自危」，检方骗搜索票、编故事，勾结媒体，这是人民对此案的普遍认知，司法该如何善后？
另外，还让柯文哲生气的是，检察官用不正讯问方式，把想要的话塞入被告嘴里，检方办案过程罄竹难书，3名公诉检察官却仍正义凛然，「我特别在乎的是检察官勾结镜新闻，这是当权者的傲慢；士大夫之无耻，是谓国耻」。最后他叹道，对外说政治归政治、司法归司法，谁会信？「我们家现在最讨厌民进党的人不是我，是陈佩琪！」此时，他回忆起过去担任台北市长的某天，晚上回家看见陈佩琪跪在地上擦地板，不禁泪眼盈眶，「我是很节俭的人，我们家里还没有佣人⋯」。
柯文哲冷静了一会儿说，最后总结，「未来仍要思考如何重拾司法信任度」。
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