建商余屋按「持有期间」而非「户数」适用差别税率，且全国22县市一体适用，1年以内适用税率2%，超过1年、2年以内税率2.8%，超过2年、4年以内3.6%，超过4年、5年以内4.2%，超过5年适用税率4.8%。
根据房屋税条例修正草案（囤房税2.0），地方政府均应订定非自住住家用房屋税差别税率，可参考财政部公告基准订定，未订定差别税率者须依财政部公告基准课征。
财政部规划，非自住住家用房屋分成3类，第一类为出租申报达租金标准及继承取得共有房屋，适用税率1.5%~2.4%；第二类为建商余屋，2年内适用税率2%~3.6%，超过2年税率2%~4.8%；第三类为「非自住自出租非继承取得房屋」，适用税率2%~4.8%。
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