审计部报告指出，政府为因应新冠肺炎疫情，编列新冠肺炎特别预算，执行期间自109年1月15日至11月30日，预算规模为8393亿余元，由卫福部等12个主管机关，以防治、纾困、振兴等三大面向推动各项因应措施。
九合一大选与18岁公民权公投将于11/26登场，时代力量立委陈椒华质询询问，许多欧美国家已经没有把新冠肺炎当一回事，已经不戴口罩、不隔离，而台湾至今已经投入预算8400亿，为提高投票率与公投复决，卫福部是否能让确诊者不用隔离去投票？
对此薛瑞元表示，隔离相关规定不是要限制民众投票权，目前也会逐步依照疫情发展做各项放宽措施，至于可不可以投票，要看投票规范是否能够允许，且相关防疫预算是为了「保障健康」，不是为了「投票权」，因此该隔离的还是要隔离。
但陈椒华追问，为何欧美可以不隔离，台湾却还是坚持相关措施？对此薛瑞元表示，「国人能不能接受，委员要思考一下」，且8400亿预算与投票权两者不能混为一谈，「我们就是负责任，才做出这样的决定。」
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