台北市医师公会常务理事洪德仁说，他在今年5/19确诊，符合新冠肺炎口服抗病毒药物用药条件，看诊医师也为他开立倍拉维的处方，但药物仅储放在核心药局、全台北市也才两家，他家住北投，家人为了帮他领药，要一路跑到士林区，堪称「天才的给药机制」，政府一直说药足够，却没想到民众不一定拿得到。
基层医疗协会秘书长罗源彰进一步批评，抗病毒药的发放流程有严重瑕疵，目前新冠肺炎口服抗病毒药物有倍拉维、莫纳皮拉韦等两种，前者效果较好、但禁忌症与交互作用众多，后者效果较差，但若病患不适合使用倍拉维，就有可能使用到，但不是每间诊所都有备药，需要到核心药局或其他有备药的医疗单位领取，才能提供给病患。
针对莫纳皮拉韦的用药情况，罗源彰说，诊所处理60到70%的新冠确诊病患，每天上午、下午都可能碰到需要使用莫纳皮拉韦的病患，却因为没有被配送此种药物，看诊完、开完处方，都要让病患「等一下」，诊所医事人员要先到核心药局拿药，再打电话跟病患说「药来了」，来一个病患就要做一次，一来一回花费很多时间，次数一多，医疗人员也会感到累。
因此，罗源彰说，基层医疗协会曾两度发文、建请卫福部调整基层诊所口服抗病毒药物莫纳皮拉韦的配置，但中央流行疫情指挥中心两度以「莫纳皮拉韦非首选药物」，是提供给血液透析、思觉失调等病患为主拒绝，最后变成「3输」局面，医事人员觉得「算了」，不开省得麻烦，让病患先观察看看、变严重再说，莫纳皮拉韦使用率偏低不是没有原因的。
另有多位专家与医事团体代表对基层药物配置提出质疑，对此薛瑞元回应，他代表卫福部感谢第一线医护人员努力，但今年开始因应Omicron疫情采取轻重分流、9成以上病患由基层照顾，这样的模式并没有错，请不要轻易攻击这样的做法，针对医师公会代表提出莫纳皮拉韦问题，会检讨改进、让药更容易取得。
薛瑞元解释，过去看的是日本经验，两种药进来，莫纳皮拉韦因为处方禁忌少，日本经验中反而用比较多，但莫纳皮拉韦效果比不上倍拉维，基于担心民众没用到比较有效的药，所以在量上面做了控制，现在基层或是医院都已经非常充分了解这些药物使用方法，也认为应该要尊重医师的临床判断，「可以承诺莫纳皮拉韦的配赋与使用（流程）会放宽。」
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