医师公会全联会指出，健保支出主要有药费、检验费、诊察费等3项，但目前3个项目的费用都不敷使用，而近期因为缺药问题备受讨论，健保署也将就「药品费用支出目标制（DET）」研议优化措施，并将在3/2由健保署长石崇良主持与医界的沟通大会，届时应会有比较明确的方向。
不过，医师公会全联会担忧，若仅就药费一块进行调整、提高相关费用，势必压缩到检验费、诊察费可分配的资源，且万一健保署在各方考量后决定废止DET制度，将使药费不加以合理管控、排挤到其它医疗支出，对台湾整体医疗环境和经济成长都会有重大伤害，因此最理想的做法还是把「饼」做大，合理增加总额给付，并同步优化DET。
医师公会全联会解释，健保总额扩大的方法有三，其一是在现有的制度架构下进行调整，提高健保费率，不过目前立院较不认同增加民众负担，医师公会全联会亦可以体谅政府考量，其二则是调整雇主与政府的健保费用负担比例后再提高费率，现行制度规定劳工应负担30%、雇主应负担60%、政府应负担10%，可调整为雇主55%、政府15%。
此外，医师公会全联会建议，亦可以针对健保法第3条规范，将政府支出稍微提高，现行规范政府每年度负担本保险之总经费，不得少于每年度保险经费扣除法定收入后金额的36%提高为40%，至于其他实行细则，可再进一步讨论。
医师公会全联会强调，缺药是一个多重因素影响的结果，不应该头痛砍头，而应该从长检讨，从速处理，以解短期缺药问题，并根本处理健保长期制度产生的病根，在尚未有适当的改善方案之前，先扩大补充健保费用预算，以免造成情况恶化而影响医疗品质与获取民众信心。
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