林姿妙涉犯贪污图利罪一审判刑7年、褫夺公权6年、洗钱罪判3年6月，她另涉犯《贪污治罪条例》公务员财产来源不明罪则被判刑2年6月、褫夺公权2年，合并执行12年6月、褫夺公权6年。
依照内政部《地方制度法》第78条第1项规定，地方县市长涉嫌违反图利罪以外的贪污治罪条例之罪，经一审判处有期徒刑以上之刑者，应停止其职务，除了图利罪要到二审才停职，其余一审判决有罪就须停职，因此，内政部依《地方制度法》规定，林姿妙一审因财产来源不明判决有罪，去年12月31日起被内政部停止县长职务，并由副县长林茂盛代理县长职务。
林姿妙不满仅因财产来源不明罪一审判刑就被停职，经与律师讨论后，该处分依据的法规有疏漏，决定向行政院提诉愿，要求停止执行停职，其诉愿申请书已于1月10日送达行政院，另外，她也向台北高等行政法院声请停止执行，诉状已于1月13日送达北高行。
林姿妙的诉愿申请书指出，88年地方制度法立法时，仅触犯《贪污治罪条例》第4条至第6条须停职，第6条之1的财产来源不明罪是98年《贪污治罪条例》修法时新增，而财产来源不明罪的刑度远低于图利罪（财产来源不明罪法定刑度为5年以下；图利罪法定刑度为5年以上），既然法定刑度较重的图利罪皆须第二审判处有期徒刑才停职，法定刑度较轻的财产来源不明罪，法律效果不应比图利罪还重，因此提诉讼要求停止执行停职处分。
