海军司令部提出三项说明：
第一、筹获潜舰是我国建军备战的长远政策，也是全民的期盼，为建构不对称战力的关键。历经近三十年努力，在政府潜舰国造政策指导、国防部督导下，由海军、台船及中科院与国内产官学界共同努力，已取得相当成果，各项进度现依计划执行，进度正常。
二、面对严峻敌情威胁，国防是国家安全的保障；潜舰战力的建构，直接关系国家的生存发展。在有限预算下，任何武器的发展，都是先求有、再求好、再求精，非一蹴可得。雄二、雄三等型飞弹如此，潜舰亦同。团队尤期待各方鼓励祝福，而非少数人的「唱衰」，若造成亲痛仇快的结果，更是遗憾。
三、部分肆意批评潜舰国造、自称「专家」者，实则于服务军旅期间历练不足、潜舰专业学养有限，并不了解潜舰国造全貌，以轻率发言攻击所有潜舰国造团队，意图制造舆论、混淆大众视听，本部表示遗憾。吁请国人明辨事实，支持国防自主政策，共同捍卫国家安全。
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