星云法师虽人在佛教，但对政治议题相当热衷，常被说是「政治和尚」，但星云认为「关心政治，不代表问政」，表示政治人物也是众生之一，并强调：「我的弟子，不分蓝绿，但都是佛教徒」。
佛光山位于大树，县市合并前是属高雄县境内，但高雄县长期绿营执政，从余陈月瑛、余政宪、杨秋兴历任县长，到县市合并后陈菊市长，无不将星云法师奉为上宾，对佛陀纪念馆15处违建争议相当包容，仅针对违反水土保持法，未依法办理整地和道路修建，裁罚45万元，违反环境影响评估法裁罚新台币90万元，「佛光山自在寮宗教事业计划」未依开发案环评内容执行，裁罚40万元，但仍全力协助行政流程，完成合法化。
1997年星云宣布佛光山将封山，要提供佛光山常住僧众一个宁静的修行环境。2000年，时任总统的陈水扁拜访佛光山，并且期许佛光山能够重启山门。佛光山稍后即决定重启山门。
但2006年8月24日百万人民倒扁运动期间，星云发表公开信，自称以「中华民国公民」身份，呼吁陈水扁总统「到了该下台的时候就应下台，以退为进，不要执著。」陈水扁入狱后，2012年释星云又表示基于慈悲仁爱与社会和谐，希望政府以人道立场优待前总统陈水扁，比照蒋介石对待张学良的方式，以「软禁」代替「拘禁」，限制其不得再从事政治活动。
2011年12月25日「佛陀纪念馆」开幕仪式，星云竟致词说此为「马英九连任献礼」，公开支持总统马英九连任。不过，民进党主席暨总统候选人蔡英文两天后仍前往佛光山参加佛陀纪念馆落成大典，高雄市长陈菊及高雄市副议长蔡昌达、 高雄立委候选人等党公职均到场陪同。
2018年11月14日参选高雄市长的韩国瑜带著妻子李佳芬携媒体拜访星云法师，大批媒体随行，前往佛光山参加水陆大会。陈其迈随后也透露，11月9日早已拜访星云大师，还说，星云大师是高雄人都非常敬重的长辈，而这是与宗教信仰相关，所以他与星云大师是私底下自然互动，不会主动对外发布任何讯息。
佛光山2022年供僧法会于8月19日在云居楼举行，高雄市长陈其迈特别莅临现场为佛光山开山星云大师献上祝福！还说「佛光山是高雄市的支柱，未来佛光山的事就是高雄市政府的事情！」
星云也时常卷入社会议题，太阳花学运期间，星云表示：「他们以为自己在搞社运，是五四运动，但五四运动是对抗国际欺凌，这次学生是内斗呀，不一样啊！」；另一方面也指「立法院不开会、政府不做事才会导致人民反弹」，要王金平尽快重开立法院会议，马英九快点出来面对。
在核四兴建争议案中，星云在2013年8月26日公开支持政府兴建核四政策，表示「灾难不能避免，就要自求多福，国家要进步，核四的兴建不能因噎废食就此停建」。不过，2014年5月，《人间福报》刊出释星云撰文，「关于核四问题，他从来没表示过意见，是大家要他表示。」「有人说，要把核废料放在佛光山，感谢你的慈悲，成就我们的牺牲，佛光山真是荣幸，有这么大的条件，也很愿意为有心人做一些贡献。」……「人以危险坚持反对兴建核四，那么，汽车不可上路，因为高速公路车祸太危险；飞机不准起航，因为空难太恐怖……依此，地球城市太小，人挤为患，大家都搬到山上与虎狼野兽同居，又有何不宜？」
星云极关注两岸关系，两岸开放探亲后，星云开始到中国进行访问及弘法。1990年前新华社香港分社分长许家屯同情民运遭调查，许家屯逃亡至美国，星云提供洛杉矶西来寺让许家屯暂时居住，星云因此无法再入境中国。1994年经中国佛教协会会长赵朴初担保，中国才再同意星云入境。2000年之后星云频繁进入中国大陆弘法，与中共官方恢复接触。2006年在江泽民接见星云之后，星云重新成为中共官方重要的宾客之一。
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