农业部表示，鸡蛋于3至6月陆续进口，但6、7月因为天气炎热、需求量降低，为免影响到蛋农，所以进口鸡蛋就没有调到市场，库存中因此陆续出现到期的鸡蛋，再加上洗选和运输的耗损，耗损与到期的进口鸡蛋共5402万颗，占比37.18%。
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进口鸡蛋有超过8成来自巴西，运输耗费45至50天，农业部3月下旬下单时缺蛋严重，但等5月初第一批鸡蛋抵达时，台湾缺蛋情况已经回稳。到期与耗损的鸡蛋中，有232万颗送往堆肥，仍有5170万等待销毁。
媒体人黄扬明则在脸书发文抨击，光是需要销毁的进口鸡蛋比例就超过1/3，等于进口鸡蛋政策把超过1/3的补贴差额税金丢进堆肥场中，「这不是浪费，什么叫做浪费？」而且销毁鸡蛋还要再额外付出成本，「完全是个赔本生意」。
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