至于中重症个案，今则增62例，包括中症36例、重症26例。
媒体询问，今确诊数达4.9万例，指挥中心评估本周才是疫情高峰可能性多高？是否影响边境开放？庄人祥回应，中秋连假可能造成波动，加上可能最近因2阶段边境开放措施，民众心态上较松懈，防疫作为没踏实，这都会影响后续疫情上升或下降，「不排除这周是高峰，但整体而言还是高原期的波动」，10/13边境开放则没有改变。
针对今增确诊，指挥中心表示，今日新增49,509例本土病例，为23,352例男性、26,140例女性、17例调查中；年龄介于未满5岁至90多岁以上；个案分布为新北市(9,495例)，台中市(6,583例)，台北市(5,296例)，高雄市(4,914例)，桃园市(4,834例)，台南市(3,745例)，彰化县(2,708例)，屏东县(1,333例)，新竹县(1,279例)，苗栗县(1,278例)，云林县(1,247例)，宜兰县(1,154例)，新竹市(991例)，嘉义县(945例)，南投县(845例)，花莲县(731例)，基隆市(685例)，嘉义市(615例)，台东县(448例)，澎湖县(175例)，金门县(172例)，连江县(36例)。
对于死亡个案，指挥中心指出，今日新增31例本土病例死亡个案，为20例男性、11例女性，年龄介于40多岁至90多岁以上，皆属重度感染、27例具慢性病史、25例未接种3剂以上COVID-19疫苗。确诊日介于今年8月19日至10月1日，死亡日期介于9月19日至10月1日。
针对境外移入，指挥中心说明，今日新增65例境外移入个案中，为35例男性、30例女性，年龄介于20多岁至70多岁，分别自英国、法国、越南、荷兰及瑞士(各2例)，马来西亚、中国、瑞典、德国及土耳其(各1例)移入，另50例感染国家调查中。入境日期介于今年8月11日至10月3日。
指挥中心统计6个月到4岁幼儿疫苗最新接种情形，昨(10/3)莫德纳幼儿疫苗和辉瑞BNT幼儿疫苗共接种2240人次，包含第一剂接种843人次，第二剂1397人次；目前该年龄层第一剂接种率39.9%，第二剂接种率9.6%。
另莫德纳次世代疫苗昨接种5万6663人次，目前累计接种21万4770人次；整体来说，昨共接种6万9630人次，目前疫苗人口涵盖率第一剂93.7%、第二剂87.8%、基础加强剂0.8%、追加剂73.3%、第二次追加剂11.1%，而65 岁以上接种率39%。
媒体询问，目前指挥中心评估次世代疫苗打气如何？什么时候进行第三阶段规划？庄人祥回应，次世代疫苗经一周接种，已施打21万人左右，且昨才进行50-64岁接种，且评估最近一周才会有大量接种，需进一步观察，但昨天接种量有较高一点；至于第三阶段，目前还在汇整卫福部传染病防治咨询会预防接种组(ACIP)专家意见及评估最近的打气，约还要过一周左右。
截至目前，国内累计18,069,311例新型冠状病毒肺)相关通报(含11,435,940例排除)，其中6,630,642例确诊，分别为35,084例境外移入，6,595,504例本土病例，36例敦睦舰队、3例航空器感染、1例不明及14例调查中。
2020年起累计11,232例COVID-19死亡病例，其中11,216例本土，个案居住县市分布为新北市2,342例、台北市1,250例、台中市1,139例、高雄市1,037例、桃园市862例、台南市849例、彰化县640例、屏东县452例、云林县350例、南投县341例、苗栗县298例、嘉义县271例、基隆市251例、宜兰县234例、花莲县198例、新竹县及嘉义市各182例、台东县158例、新竹市128例、澎湖县32例，金门县20例；另16例为境外移入。
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