去年7月5日上午，王鸿薇召开记者会爆料，质疑当时担任新竹市长并有意前往桃园参选市长的林智坚，在就读中华大学的硕士论文「以TCSI 模式评估国内某科学园区之周边居民满意度」，涉嫌抄袭新竹科学工业管理局发标45万的委办案结案报告(采购案号E961209)，题目「以TCSI模式评估新竹科学园区之民众满意度」，就连错字「蓝」球场也完全相同，抄袭比例达87.8%。随后又公布「抄袭拼图」，再增抄袭2005年12月的品质月刊，指林智坚论文全数抄袭比例达94.1%。
林智坚则召开记者会反击，中华大学论文是在一场研讨会与教授们共同发表研究，表示自己重视个人和团队名誉，对于过去有人借由造谣抹黑，图谋政治利益，企图摧毁他的名誉，他绝对都会捍卫名誉，透过法律杜绝抹黑造谣，同时委托律师前往新竹地检署对王鸿薇提起加重诽谤罪告诉。
新竹地检署认为无管辖权，向高检署声请将全案移转由北检侦办，检察官调查后认为王鸿薇在召开记者会的当天，有提供林智坚的论文资料供媒体比对，且中华大学在事后撤销林智坚的硕士学位，因为认为王鸿薇爆料有所本，处分不起诉。
对此，王鸿薇回应，是迟来的正义，并指在第一时间就已反控林智坚诬告。
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