警方确认洪、孔 2 嫌涉违反枪砲弹药刀械管制条例、恐吓、国安法及两岸人民关系条例等，因怀疑尚有共犯在逃，及相关事证有待追查，下午已解送台南地检署侦办，会建议向法院声请羁押禁见。
台南市政府警察局刑警大队大队长林宏升指出，专案小组追查重点在于枪击案动机、枪枝下落及是否仍有共犯在逃，但认为2嫌供称避重就轻，包括声称将作案用枪枝留在海边、去年 11月一起搭渔船偷渡到中国等，怀疑有意扰乱侦办之嫌。是否有人在中国接应， 2 嫌虽供出若干绰号，但也有可能是推托说法，专案小组都还要一一比对查证。
洪政军向警方供称，因不满郭再钦未履行已故地方闻人陈世铭生前协调的工程分配，事后又耳闻郭还向警方施压，要求加速缉捕，因此策画这起枪击案报复。
洪政军透露，犯案动机起因不满郭再钦未把应给的绿能工程案件交付给他，事后还听闻郭再钦动用警政关系来追缉他；而台南市前议员谢财旺与郭再钦「走得很近」，所以针对这2人开枪警告。
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