新北环保局表示，接获通报后立刻赴现场检测水质，其水色正常且经现场快筛无急毒性反应，溶氧值偏低(2.06mg/l)，于较深河床仍有发现活鱼，经沿线巡查皆未发现异常排放废水情形。
此外，本次事件咨询嘉南药理大学黄大骏教授，其表示依鱼体照片判断，鱼眼呈现浊白状况，鱼鳃呈现粉红色情形，研判鱼只死亡时间为水体溶氧量较低的清晨。且该处发现之死鱼，其死亡时口部微张，同时死亡鱼只体型偏大。
跟据气象资料显示，1日~4日皆属于高温的状况，死鱼主因主要为水中的有机物质经高温下快速分解，使得水体溶氧缺乏因而造成鱼类缺氧死亡。
因新店溪横跨新北市及台北市，目前两市分别自7日起，由新北市高滩处及台北市水利处连续多日派遣人力及船只进行清理，截至11日共派出打捞船只23船次、收运车辆10车次、清洁人力逾百人次，清除约14.03公吨死鱼鱼体。双北仍持续打捞中，惟部分河段受涨退潮影响增加打捞作业难度，预估本周应可清理完成。
新北环保局说明，死鱼发生情形最常见的包括水环境温度急遽变化、连日下雨或无雨、水中污染浓度高及夜间微生物耗氧反应等等，经环保局分析近3年鱼群暴毙最常发生的月份为4月起至夏季，由于4月份为新店溪年度统计流量中最低之月份，后续至夏季期间，主要因素包含为温度急遽变化，水中底泥厌氧反应旺盛等因素，导致水环境缺氧，不耐缺氧环境的鱼种即会死亡。
环保局强调，目前已有死鱼紧急应变机制，发现鱼群死亡后，立即前往现场确认水质、鱼体，沿线巡查周边及上游有无异常排水，亦请专家协助判断死鱼原因，厘清是否有工厂污水排入导致鱼群死亡，并横向通报水利单位派员清除，以避免鱼体腐烂导致恶臭影响环境卫生。
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