陈明通今日赴立院外交国防委员会答询，针对昨遭爆担任新竹市前市长林智坚指导教授前后，曾收受同一捐款来源高达400万的捐款争议，本来面对媒体询问时说「陈局长不回陈教授问题」，更说「中华民国的宪法没有叫教授来立法院的」，但因为蓝委不断逼问，最终他终于松口回应，强调募款的钱都是为了维持中国大陆研究中心营运，他没拿一毛钱，更感叹不要为了选举、罗织抹黑到这种程度。
但在他解释完后，马文君、吴斯怀、温玉霞、江启臣、廖婉如等5位蓝委仍提出临时提案，要求陈明通主动向国人公开说明与捐赠人的关系和金流收受动向，以视正听。
不过针对临时提案的内容，由于用字强硬程度问题，内文提到「国营航空被迫购买波音787，国安局长公开说谎」、「全力帮林智坚论文抄袭丑闻多次发文护航」等等，认为他对国会不诚实、对重大业务不用心，直言陈明通不具担任国安最高情治首长的资格，引得在场绿委反弹。
立委林静仪指出，针对第一段内文不论两岸议题或是行程，用字上可以再「中性」一些，但民间捐款问题是捐到台大，应该是教育文化委员会处理；立委何志伟也说，台大是台湾最好的大学，金流、捐款应该对学术伦理要有信心，但因为他现在局长有局长的机敏性，所以他也要求到教育文化委员会处理。
立委王定宇也赶来了解状况，说时间序列上是何其荒谬跟可笑，则特定事件导向逻辑的因果关系，应该可以辨别出来；同时公用捐款上，我们在这边处理这个提案跟业务并无关系，若到教委会他尊重，学术单位公开合法的捐款是我们鼓励，这是长期发生的，若要择一事件扭曲，这不该是委员会处理的，提案文字修正，大家讨论处理。
眼见气氛有些僵硬，蓝委吴斯怀出面缓颊，表示只要把刚刚的说明，更完整有次序的书面报告就可以了，至于司法程序让司法去走。只是因为陈明通身分敏感，所以才受到最严格检视，如果只是要修饰文字，是可以讨论的。
后来马文君宣布休息5分钟，针对此事协商，最后将原本第一段的内容删除，略微修正第二段的内文通过。
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