黄扬明在脸书分析，林智坚道歉文中，开宗明义就提及民进党中执会上周的决议，并提及：「避免因我个人的问题，成为投身政治领域者的困扰，更不希望成为对手政党持续攻击民进党的议题。」可研判民进党主席赖清德一定透过各种管道说服林智坚退出「战清白」的战场，「政治因素」、「大局为重」是林智坚发文的主要动机。而他的认错只是危机处理、政治妥协。不过陈明通却不懂政治处理的逻辑，仍坚持其「明通宇宙」论述到底。
「根据我的了解，从去年7月起，特别是台大论文的部分，林智坚始终是被陈明通带著打仗。」黄扬明指出，陈明通每一次声明发完，林智坚就会在当天或隔天开记者会发动攻势，陈明通就这样扮演著「幕后黑手」的角色。甚至，连余正煌在7月初卷入论文案之后，当时身为余博班指导教授的陈明通，都要求余不要对外发表任何说法，直到余正煌得知林智坚反控是余抄袭，才忍不住透过律师发声明捍卫自身清白。
黄扬明认为，「整个局，都是陈明通一手造成，当林智坚也背离陈明通而去，阿通师又能怪谁呢？」
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