国民党立院党团指控，高端疫苗日前宣布，与韩国 GC Pharma 合作的四价流感疫苗通过食药署药品查验登记，将抢占国内每年高达600万剂的公费流感疫苗市场，质疑高端流感疫苗通过查验的过程疑点重重，蔡政府为了拯救营收归零的高端，而大开后门。
立法委员王鸿薇解释，依照药品查验登记审查准则，疫苗类药品要免除国内临床试验，必须要符合原产国已上市、且具有十大医药先进国采用证明。王鸿薇质疑，因韩国都不在十大医药先进国里，高端原本规划进口韩国的「成品疫苗」，后来改成「进口原液」填充，都必须完成临床试验，但至今过程不明。
依据卫福部提供给王鸿薇办公室的回函，目前流感疫苗采购已循例询问持有食药署核发的四价流感疫苗查验登记许可函厂商参标意头及供货情况，包括国光、赛诺菲股份有限公司、荷商葛兰素史克、台湾东洋、高端疫苗生物制剂股份有限公司等5家，正规划采购案，预计于4月上旬进行招标作业。
对于相关争议，薛瑞元表示，台湾是法治国家，一切依法行政，如果高端符合相关规定，只能予以通过，而流感疫苗采购目前还在规划中，没有确定的数字，但只要厂商符合资格，就可以参与议价。
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